Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VhlP40338 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VhlP40338 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms