Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms