Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin1P35438 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grin1P35438 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grin1P35438 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grin1P35438 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms