Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc10P31257 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms