Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnd1P30999 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms