Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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RxrgP28705 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrgP28705 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrgP28705 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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