Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RxrbP28704 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RxrbP28704 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RxrbP28704 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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