Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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