Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa2P28309 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms