Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChgaP26339 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms