Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RdxP26043 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RdxP26043 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RdxP26043 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RdxP26043 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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