Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3aP23116 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms