Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RarbP22605 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RarbP22605 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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