Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TP20293 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TP20293 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TP20293 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TP20293 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TP20293 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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