Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VimP20152 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VimP20152 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VimP20152 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VimP20152 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms