Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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