Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxcl9P18340 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms