Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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