Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gata1P17679 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms