Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pou4f1P17208 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms