Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LdhbP16125 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms