Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30aP15533 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms