Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms