Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa1P11477 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms