Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Eb1P04230 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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