Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa7P02830 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms