Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01739 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01739 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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