Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01659 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01659 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01659 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01659 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01659 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01659 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01659 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01659 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01659 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01659 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01659 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01659 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms