Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01648 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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P01648 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01648 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01648 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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