Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4bP01029 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4bP01029 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4bP01029 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4bP01029 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms