Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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