Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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AurkcO88445 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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AurkcO88445 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AurkcO88445 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms