Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copb2O55029 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms