Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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BckdkO55028 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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BckdkO55028 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
BckdkO55028 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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