Protein–RNA interactions for Protein: O55022

Pgrmc1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgrmc1O55022 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgrmc1O55022 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms