Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlkO54988 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlkO54988 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms