Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn5O54942 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn5O54942 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms