Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnd2O35927 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnd2O35927 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms