Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pik3cdO35904 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pik3cdO35904 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms