Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk2O35491 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms