Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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ColqO35348 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ColqO35348 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ColqO35348 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ColqO35348 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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