Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms