Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
LfngO09010 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LfngO09010 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LfngO09010 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms