Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms