Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp12O08736 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms