Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20878L7N244 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms