Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20939L7N243 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Gm20939L7N243 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20939L7N243 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20939L7N243 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20939L7N243 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20939L7N243 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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