Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Gm21887J3QQ04 AC160413.2-201ENSMUST00000217790 2280 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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