Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim22J3QP37 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms