Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm21976J3QNN2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm21976J3QNN2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms